Уступив в 1/8 финала розыгрыша Кубка России «Ростову», «Спартак» подтвердил репутацию одной из самых неудачливых команд в играх на выбывание, если дело доходит до пенальти.«Ростов», можно сказать, реабилитировался за поражение в финале Кубка-2002/03: тогда москвичи победили за счет единственного гола, автором которого стал Егор Титов. С тех пор красно-белые только один раз добирались до финала, а в четырех попытках проникнуть в следующую стадию с помощью серии 11-метровых неизменно терпели неудачи. Причем три из них пришлись на три последних розыгрыша Кубка.
2003/04. 1/16 финала
«Спартак» — «Кубань» (Краснодар) — 1:2 и 1:1
2004/05. 1/16 финала
«Спартак» — «Металлург»(Липецк) — 0:2 и 1:1
2005/06. Финал
ЦСКА — «Спартак» — 3:0
2006/07. Полуфинал
««Локомотив» (Москва) — «Спартак» — 3:0 и 2:1
2007/08. 1/16 финала
«Терек» (Грозный) — «Спартак» — 1:1, по пенальти — 4:3
2008/09. 1/4 финала
«Спартак» — «Динамо» (Москва) — 0:3
2009/10. 1/8 финала
«Спартак» — «Москва» — 1:2
2010/11. Полуфинал
«Спартак» — ЦСКА — 3:3, по пенальти — 4:5
2011/12. 1/8 финала
«Спартак» — «Волга» (Нижний Новгород) — 1:1, по пенальти — 5:6
2012/13. 1/8 финала
«Ростов» (Ростов-на-Дону) — «Спартак» — 0:0, по пенальти — 3:2